Japon halkının, ırk olarak genellikle Çinlilerle, Korelilerle ve hatta Kore’nin kuzeyindeki kavimlerle de akraba, mongoloit ve Ural-Altay ırkından oldukları çok kabul gören bir ifadedir. Arkeolojik bulguların bu ifadeyi kanıtladığı da söylenir. Ancak Japon anavatan adalarını oluşturan adaların Asya anakarasına bağlı ve onun bir parçası olduğu buzul çağından bu yana Japonya’ya, Asya anakarasına en yakın olduğu yer olan Kore Yarımadası üzerinden göçler olduğu gibi, Japon Akıntısı olarak da bilinen ve güneyden gelerek Japon adalarını yalayan “Kuroşio Sıcak Su Akıntısı”’ın sürüklemesiyle, Formoza ve Ryukyu adaları üzerinden Malezya’dan ve Pasifik adalarından da göçler olduğu ve bu değişik gurupların, bugün hâlâ Hokkaido Adası’nda ilk halleriyle rastlanabilecek Amerika’nın kızılderililerinin benzeri, yerli halk olan Aynuları da aralarına alarak, o dönemden itibaren başlayan karışımlarının, bugünkü Japon toplumunu oluşturduğu kabul edilebilir.
Doğal olarak, Japon anavatan adaları, Asya anakarasından ayrıldıktan sonra, insanlar aynı topraklarda yaşamak, aynı ülkeyi ve doğayı paylaşmak zorunda kaldıkları için de karışımlar süratli, yan tesirlerden uzak ve iz bırakmadan olmuştur.